Царь Фёдор Иванович умер в ночь с 6 на 7 января 1598 года. Его похоронили в Архангельском соборе — усыпальнице московских князей и царей. «И был в Москве в день его погребения плач и вопль великий, так что и пения не было слышно из-за плача. И если кто-нибудь произносил какие слова, то и тех нельзя было из-за плача услышать», — сообщал летописец.
Царь Фёдор Иванович — последний из потомков Ивана Калиты; с его смертью угасла династия Рюриковичей, представители которой правили Русью более семисот лет. Россия осталась без царя. Бояре стали целовать крест вдове умершего государя, царице Ирине Фёдоровне Годуновой. Но та не захотела царствовать и удалилась в Новодевичий монастырь, где приняла пострижение в монахини с именем Александры. Вслед за сестрой в Новодевичий монастырь отправился и Борис Фёдорович Годунов.
